Σε ένα κατσαρολάκι λιώνουμε το βούτυρο σε μέτρια θερμοκρασία και στη συνέχεια προσθέτουμε το ψιλοκομμένο σύγκλινο και σιγά σιγά το σιμιγδάλι ανακατεύοντας συνεχώς, μέχρι να ομογενοποιηθούν.
Συνεχίζουμε ρίχνοντας σταδιακά το γάλα, ανακατεύοντας καθ’ όλη την διάρκεια, μέχρι το μείγμα να γίνει πηχτό και λείο. Προσθέτουμε αλάτι, πιπέρι, το θυμάρι, ανακατεύουμε και αφαιρούμε την κατσαρόλα από την εστία. Αφήνουμε το μείγμα στην άκρη μέχρι να πέσει λίγο η θερμοκρασία του.
Σε ένα μπολ θρυμματίζουμε τη φέτα σε μεγάλα κομμάτια, προσθέτουμε τη γραβιέρα και τα ενσωματώνουμε στο μείγμα.
Λαδώνουμε καλά μια ταρτιέρα, απλώνουμε τη μια ζύμη κουρούκαι πιέζουμε καλά έτσι ώστε να φορμαριστεί σωστά. Με την πίσω πλευρά ενός μαχαιριού ‘ξύνουμε’ το χείλος της ταρτιέρας για να κόψουμε τη ζύμη που προεξέχει, με την οποία συμπληρώνουμε τα κενά που υπάρχουν.
Περιχύνουμε στην ταρτιέρα την αλμυρή κρέμα μπουγάτσας και με ένα κουτάλι ή πλαστική σπάτουλα ζαχαροπλαστικής τη στρώνουμε ομοιόμορφα.
Ψήνουμε για 30 – 35 λεπτά ή μέχρι να έχει ένα ωραίο χρυσαφένιο χρώμα.