Βράζουμε τα μακαρόνια σε αλατισμένο νερό, σε δυνατή φωτιά, για 8 λεπτά. Τα σουρώνουμε και κρατάμε 1/2 κούπας / 120 γρ. από το νερό.
Παράλληλα, βάζουμε τα τοματίνια στο μπλέντερ και τα χτυπάμε μέχρι να γίνουν σάλτσα. Xρησιμοποιούμε τοματίνια γιατί είναι πιο γλυκά. Μπορούμε όμως αντί για τοματίνια να βάλουμε 2 μεσαίες τομάτες.
Ζεσταίνουμε μία μεγάλη κατσαρόλα σε μέτρια προς δυνατή φωτιά, ρίχνουμε τις 3 κ.σ./40 γρ. ελαιόλαδο και τσιγαρίζουμε το κρεμμύδι. Μετά από 2 λεπτά προσθέτουμε το σκόρδο και τα κολοκυθάκια και μαγειρεύουμε για άλλα 2-3 λεπτά.
Προσθέτουμε τα μακαρόνια, τη σάλτσα τομάτας, το ανθότυρο , το προσούτο, το θυμάρι, το μπούκοβο, αλατοπιπερώνουμε και ανακατεύουμε. Στη συνέχεια προσθέτουμε την 1/2 κούπα / 120 γρ. νερό που κρατήσαμε από τα μακαρόνια, το το 1/4 κούπας / 60 γρ. ελαιόλαδο και ανακατεύουμε γρήγορα εκτός φωτιάς. Τέλος ρίχνουμε το φρέσκο κρεμμύδι.